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医疗无尘车间的洁净室是指将一定空间范围内之空气中的微粒子、细菌等之污染物排除，并将室内之温度、洁净度、室内压力、气流速度与气流分布、噪音振动及照明、静电控制在某一需求范围内，而所给予设计建成的医疗无尘车间洁净房间。医疗无尘车间内洁净室的原理。洁净室是利用HEPA、空气净化设备，其尘埃的收集率达99.97~99.%之多，因此经过此过滤器过滤的空气可说十分干净。然而洁净室内除了人以外，尚有机器等之发尘源，这些发生的尘埃一旦扩散，即无法保持洁净空间，因此利用气流将发生的尘埃迅速排出室外。
无尘车间净化工程最主要的作用在于控制产品所接触的空气的无尘度及温湿度，使产品能在一个良好的环境空间中生产、制造，此空间我们称之为无尘车间。按照国际惯例，无尘净化级别主要是根据每立方米空气中粒子直径大小划分标准的粒子数量来规定。
增加了公制单位，洁净室等级以‵M′字头表示，如M1、M1.5、M2.5、M3….以此类推，配合公制单位之标准化，M字母后之阿拉伯数目字是以每立方公尺中=0.5μm之微尘粒子数目字以10的幂次方表示，取指数为之，若微尘粒子数介于前后二者幂次方之间，则以1.5、2.5、3.5….表示。美国联邦标准FS 209D都以英制每立方英尺为单位，日本则是采用公制，即以每立方公尺为单位，以0.1μm微粒子为计数标准。日本标准之表示法以Class 1，Class 2，Class 3……Class8表示，度的等级为Class 1，差则为Class 8，以每立方公尺中微尘粒子总数中化为10的幂次方，取其指数而得。
非单向流净化车间非单向流的净化原理是靠送风气流不断稀释室内空气，把室内污染逐渐排出，达到平衡，即稀释原理。具体来讲，就是利用干净气流的混合稀释作用，把室内含尘浓度很高的空气稀释，使室内污染源所产生的污染物质均匀扩散并及时排出室外，降低室内空气的含尘浓度，使室内的洁净度达到要求。非单向流净化车间的气流流型又可分为顶送下回、顶送下侧回、顶送顶回等。一般形式为过滤器送风口顶部送风；回风的形式有下部回风、侧下部回风和顶部回风等。依不同送风换气次数，实现不同的净化级别，其初投资和运行费用也不同。非单向流净化车间的特性包括:换气次数，与舒适性空调相同；气流组织，即能均匀地送风和回风，充分发挥洁净气流的稀释作用，要求单个风口有的扩散作用，整个净化车间室内风口布置均匀，数量尽可能多，要尽量减少涡流和气流回旋；自净时间，室内从某污染状态降低到某洁净状态所需要的时间，自净时间越短越好。非单向流净化车间自净时间一般不超过30min。