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无菌车间又称无菌室。它的要求更高。除了按照洁净室的要求对空气中的微粒进行处理外，还需要对室内空气进行，即在去除生物污染源的同时，还要对室进行检查。对室内空气进行采样培养，消除传染源。医院手术室、血液透析室、品、三类一次性医疗用品的生产需要使用无菌室;但是，浮游细菌和沉降细菌等菌落的数量需要在测试期间进行检测。洁净室净化工程装修标准及解决方案无菌的定义要求没有活的微生物。为了实现无菌车间无活微生物，在无菌车间的产品生产过程中，需要采用各种方法去除产品中原有的微生物，产品被微生物污染。
每立方米将小于0.3微米粒径的微尘数量控制在3500个以下，就达到了无尘标准的A级。目前应用在芯片级生产加工的无尘标准对于灰尘的要求高于A级，这样的高标主要被应用在一些等级较高芯片生产上。微尘数量被严格控制在每立方米1000个以内，这也就是业内俗称的1K级别。工业洁净车间管道布置的一般原则管路的布置类型一般有如下几种:埋地敷设管路；管沟敷设管路；沿地敷设管路；架空敷设管路。在管道布置设计时，首先要统一协调工艺和非工艺管的布置，然后按工艺流程并结合设备布置、土建情况等布置管道。
十万级无尘车间对温度、湿度没有特殊要求时，冬季温度一般控制在冬季20—22℃；夏季温度一般控制在24—26℃；允许波动的范围是±2℃。而冬季洁净室湿度控制在30—50％，夏季无尘车间湿度控制在50—70％。
洁净室是指将一定空间范围内之空气中的微粒子、有害空气、细菌等之污染物排除，并将室内之温度、 洁净度、室内压力、气流速度与气流分布、噪音振动及照明、静电控制在某一需求范围内，而所给予设计之房间。亦即是不论外在之空气条件如何变化，其室内均能俱有维持原先所设定要求之洁净度、温湿度及压力等性能之特性 洁净室主要之作用在于控制产品（如硅芯片等）所接触之大气的洁净度日及温湿度，使产品能在一个良好之环境空间中生产、制造，此空间我们称之为洁净室。按照惯例，无尘净化级别主要是根据每立方米空气中粒子直径大于划分标准的粒子数量来规定。也就是说所谓无尘并非100%没有一点灰尘，而是控制在一个微量的单位上。当然这个标准中符合灰尘标准的颗粒相对于我们常见的灰尘已经是小的微乎其微，但是对于光学构造而言，哪怕是一点点的灰尘都会产生大的负面影响，所以在光学构造产品的生产上，无尘是的要求。